Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C5orf51A6NDU8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C5orf51A6NDU8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms