Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PSDA5PKW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PSDA5PKW4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms