Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMD3A2A2Y4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FRMD3A2A2Y4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMD3A2A2Y4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms