Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RRA0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms