Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAV27A0A087WT01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAV27A0A087WT01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV27A0A087WT01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms