Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPACA6W5XKT8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms