Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms