Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2AQ9UQM7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms