Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA11Q9UKX5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms