Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSKSQ9UJT2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms