Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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RABGEF1Q9UJ41 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RABGEF1Q9UJ41 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RABGEF1Q9UJ41 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RABGEF1Q9UJ41 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RABGEF1Q9UJ41 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RABGEF1Q9UJ41 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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