Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP68Q9UHB9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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