Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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