Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms