Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms