Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms