Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms