Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms