Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms