Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD3Q9BZ95 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms