Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms