Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms