Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTA3Q9BTC8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTA3Q9BTC8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTA3Q9BTC8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTA3Q9BTC8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTA3Q9BTC8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTA3Q9BTC8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTA3Q9BTC8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms