Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM29Q9BSF4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM29Q9BSF4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms