Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms