Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms