Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms