Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK2Q96PF2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms