Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms