Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms