Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms