Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms