Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 CNTNAP3B-211ENST00000612828 7455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SPTSSBQ8NFR3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms