Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE22Q8NFJ8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms