Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms