Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms