Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM61Q8N0U2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms