Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms