Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FUNDC1Q8IVP5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms