Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms