Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPTE2Q6XPS3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms