Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms