Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms