Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms