Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms