Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms