Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms