Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEXMIFQ5QGS0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms