Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms