Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms